En esta localidad se encuentra el Puerto de Iquique, cuyos Muelles Nº1 y Nº2 son operados por la Empresa Portuaria de Iquique, bajo el esquema multioperador, y los Muelles Nº3 y Nº4 operados por Iquique Terminal Internacional (ITI). En dicho puerto se encuentran también los Terminales Off Shore Oil - Petrobras y Off Shore Oil - Copec. En esta localidad también se encuentra el Terminal TPM.
Producto de los terremotos que han afectado a la zona, el Puerto de Iquique se encuentra ejecutando la primera etapa de reconstrucción del puerto, que busca habilitar el terminal en las mismas condiciones previas a los sismos.
Respecto al tonelaje movilizado por la localidad, se destaca la carga general, con cerca de un 72,0% del total de toneladas movilizadas. Mientras que los graneles líquidos equivalen al 6,4%, aproximadamente.